基本的に、時の探検隊・闇の探検隊の進化版として、空の探検隊は発売されているので、多くの機能が追加・変更されている。

中でも、施設や、新ダンジョン、そして新エピソードがあるという違いがある。

ほかには、登場するポケモン、アイテムも違う模様。

今回は、アルセウスやシェイミ（スカイフォルム）の登場もあるようです。